警惕!近百人核酸检测多次才转阳 或是病毒突变导致

警惕!近百人核酸检测多次才转阳 或是病毒突变导致

新冠确诊病例在全球已经突破1亿人。在中国,疫情在入冬之后也有死灰复燃的情况,为了保障春运、春节的安全,很多地方加大了病毒检测的力度,而肛拭子检测,是如今在一些地方新增加的检测项目。

警惕!近百人核酸检测多次才转阳 或是病毒突变导致

增加肛拭子检测,目的是为了增加病毒的检出率。如果要说核酸检测,中国应该是世界上最强的国家,没有之一,之前已经在武汉、青岛、喀什等地方都做了全员检测,因为及时的检测,从武汉到之后各地零星出现的疫情,都被及时扑灭,按理说中国应该非常有经验、非常有信心对待出现的疫情。是什么情况导致了肛拭子检测的出现呢?

这跟多地出现的“多次检测阴性后转阳”的感染者有关。

在12月26日,顺义出现了疫情,流调溯源到的“零号感染者”,于2020年11月26日从印尼入境福建,同机同排座位旅客在入境后确诊。但是,这名男子在福建按照规定隔离14天期后,核酸检测结果为阴性,解除隔离后于12月10日到北京顺义区居住地。在当地发现疫情后,该男子只是血清IgM抗体阳性,新冠病毒核酸检测结果仍为阴性,此时他离密切接触同机感染病例的时间已经30天。在第32天时,核酸检测才出现阳性,被诊断为无症状感染者。

在1月24日,河北省卫健委公布了头一天确诊的17个病例,其中的病例15是藁城区居民,1月2日至1月9日居村无外出,期间3日、4日、5日、8日4次核酸检测均为阴性;1月10日转运至藁城区指定隔离点进行集中隔离医学观察,当日核酸检测呈阴性;1月11日因发热转运至晋州市人民医院发热门诊,直至1月21日均在发热门诊隔离病房进行治疗,期间8次核酸检测均为阴性;在1月22日,核酸检测才出现阳性。

根据第一财经的报道,在石家庄的核酸筛查中,这种“多次核酸检测为阴性,最后才确诊阳性的病例” 并不少见。在石家庄市1月15日~21日确诊的222例病例中,有190人进行两次以上核酸检测才确诊,最多的是1月20日确诊的一个病例,进行了10次核酸检测,从1月3日持续到1月20日,前后达17天。

核酸检测“多次阴性”失效,真正原因可能是病毒突变了

大家可能听说了,病毒突变之后,可能会对疫苗的效果产生影响。目前已经有数据表明,南非变异体能让一些疫苗的保护率有所降低。

那么,病毒突变导致检测失败的可能性存在吗?肯定的!这已经有先例了。

英国出现病毒变异株B1.1.7, 在病毒的S基因处有数个突变,而S基因也是目前很多核酸检测所针对的区域。对此,世界卫生组织就已经发出公告警示,表明B1.1.7变异株S基因69/70位置的缺失突变,会影响现有的核酸检测。

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美国FDA也对此做出了警示。在FDA的“温馨提示”信件中,还具体列举了几个可能会受到突变影响的试剂盒:

?Accula SARS-Cov-2 检测 (Mesa Biotech):如果病毒在第28881个碱基处发生突变 (GGG to AAC),该试剂盒检测会受到影响;

?TaqPath COVID-19 Combo 试剂盒(Thermo Fisher Scientific):该试剂盒同时检测三个基因,英国出现的变异体B.1.1.7会影响其中一个检测结果;

?Linea COVID-19检测(Applied DNA Sciences): 该试剂盒同时检测两个基因,英国出现的变异体B.1.1.7会影响其中一个检测结果;

做核酸检测的美国公司Helix也注意到了病毒突变对检测的影响(4)。该公司的核酸检测同时测3个新冠病毒的基因:ORF1ab, N,和 S基因,因为英国出现的B.1.1.7.毒株在S基因上有缺失突变,检测中能检出ORF1ab和N,但是检不出S基因(4)。这个现象,叫做“S基因退群”。

正是因为有这个“S基因退群”现象,目前类似Helix公司的核酸检测,也可以初步用来判断样本中的病毒是否是B.1.1.7.毒株。

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因为病毒突变,导致河北的检测多次出现阴性的可能性有多大?

根据第一财经的调查报告,在前面提到的石家庄市病例15的检测过程中,在1月18日以前,核酸检测结果都为阴性。但是,因为患者已经出现了临床症状,医院在18日使用了多种核酸诊断试剂进行检验。使用医院之前采购的某企业A核酸诊断试剂,核酸检测结果还是阴性,送到中医院进行检测,结果依然是阴性。但是如果换用S企业的核酸检测方法,结果就是阳性!

1月22日,再次同时使用了A企业和S企业的两种不同检测方法,结果仍然是A企业的检测为阴性,S企业的的阳性。很显然,这两种检测结果之中,必须有一个是正确的。因为当天也进行了新冠病毒的抗体检测,结果为阳性,所以S企业的检测结果是准确的。

在核酸检测中,对于每一个靶标,需要有两个引物序列和一个探针序列。如果病毒在这些引物或者探针的序列处发生突变,就会影响检测的效率。在中国疾控中心发布的《新型冠状病毒感染的肺炎实验室检测技术指南》中(下面简称《技术指南》),新冠病毒核酸检测的两个靶标分别为ORF1ab 基因和N基因。

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目前在河北流行的病毒株,会不会正好在这些关键的部位出现突变呢?

1月6日,《中国疾病控制预防中心周报》公布了石家庄和邢台两例新冠病毒感染的病毒基因测序分析结果 。根据所公布结果,这次河北藁城流行的毒株,与近期国内其它地方疫情中发现的毒株不同,与去年7月份在俄罗斯报道的毒株同源,属于B.1.1.123毒株。

很巧的是,这种毒株的病毒基因上第28881~28883位碱基处正好发生了突变,而这里正好是N基因的正向引物的位置!

是否A企业的双靶标试剂盒使用的引物正好与《技术指南》相符,导致检测结果受到基因突变影响?而S企业的试剂盒正好完美地躲过了这个突变?这需要有关方面来揭开谜底。

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来源:中外医讯(medinfo-au)

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