去美国看病 如何评价测序的整体质量及用处

国外方面,为验证测序的性能,在每一次检测中应设置阳性和阴性扩增对照。阳性扩增对照可以验证扩增失败,是否是由于样品本身的原因。去美国看病在每次检测中,对每个PCR反应缓冲液,都应设置阴性对照或空白无模板对照,确保没有发生外源性DNA的污染。

在Sanger测序数据分析之前,应首先评估测序峰图的质量。质量指标主要包括测序峰图的振幅和峰图的背景。峰值的振幅应足够高,这样才可以识别出灵敏度范围内的低水平突变,EGFR缺失突变检测,应低于每个横跨感兴趣区域核苷酸信号主峰值强度的5%。去美国看病服务机构爱诺美康介绍到,此外,整个检测中的信噪比应低于2.5%,并且对于评价测序的整体质量也十分有用。

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尽管可以采取一些措施,以保证测序峰图的质量,但依然存在无法消除的低水平背景,因此,强烈建议采用双向测序。双向测序可大大降低因测序过程中,背景噪声或聚合酶失真而产生假阳性结果的风险。在每一批去美国看病的检测中,也应设置阴性对照以进一步区分背景信号,和真正的突变信号。由于存在主观性,需要1名以上的人员分别对测序结果,进行分析并达成共识。

去美国看病服务机构爱诺美康介绍到,假如对样品的突变状态无法达成共识,且剩余足够的样品,可重复检测以确定检测结果。也可以从同一标本中,重新提取核酸以获得更多的样品重新检测。然而,需要注意的是由于肿瘤的异质性,从肿瘤样本中重新提取的用于确认突变的核酸,也可能产生不同的结果。这种情况在近由CAP组织的一项KRAS测试中得到证实,这项测试(CAP2010 KRAS-B)的结果显示,2/3的参与实验室验证了样品的KRAS突变,而1/3的实验室却没有检测到。

这些检测到的测试结果的差异,可能是由于肿瘤的异质性造成的。去美国看病后,基因芯片是一种以寡核苷酸微阵列为基础的检测技术,该技术可在单个反应体系检测大量的RNA转录体,或鉴别基因拷贝数的变异。

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